星舰如流星划破蓝星的大气层，陈默的意识在数据流中剧烈震颤。舷窗外，这颗星球呈现出诡异的双色地貌：北半球被晶莹剔透的水晶森林覆盖，折射出七彩光晕；南半球却翻滚着暗紫色的液态金属海洋，不时腾起尖啸着的机械触手。当星舰掠过赤道上空时，陈默的视网膜突然浮现出母亲日记中的潦草字迹——「小心光与影的交界」。
“警告，检测到未知能量场。”星舰AI的声音突然变得尖锐，水晶森林中升起十二座金字塔状建筑，表面流转的符文与狄俄涅核心产生排斥性共鸣。陈默试图操控星舰转向，却发现金属骨架传来刺骨的寒意——某种力量正在侵蚀他与星舰的连接。
地面上，一群身披半透明鳞甲的生物从金字塔中走出。他们的额头镶嵌着菱形晶体，手中握着由光凝聚的长矛。为首者张开布满利齿的口器，发出的声波竟直接在陈默意识中形成画面：蓝星原住民曾与深潜者签订契约，用人类灵魂换取操控金属海洋的技术。
“你们是亵渎神明的外来者！”为首者的声波带着灼热的怒意，十二座金字塔同时发射出紫色光束，在星舰周围编织成牢笼。陈默的机械义肢突然脱离星舰实体化，他握紧由数据流凝成的光刃，准备强行突破。就在这时，零号的钻探舰从液态金属海洋中破水而出，舰首的血月棱镜碎片与金字塔产生共鸣，牢笼的能量瞬间增强十倍。
“好久不见，星舰驾驶员。”零号的身影出现在全息投影中，他的脊椎刺青已经蔓延至脖颈，“蓝星的原住民不知道，他们的‘神明’不过是深潜者丢弃的实验品。而我，将在这里完成‘火种净化’。”他的钻探舰展开数百个发射口，倾泻出装载着深潜者胚胎的孢子舱。
陈默的意识突然被拉入记忆回廊。画面里，母亲穿着蓝星原住民的服饰，正在金字塔中与为首者激烈争执，她的手中紧握着半块刻有星舰图案的水晶。记忆戛然而止时，陈默发现星舰的能量核心出现裂缝，零号的孢子舱正在腐蚀水晶森林，将其转化为散发恶臭的黑色沼泽。
“连接星舰引擎，用陨石能量逆转频率！”陈默的机械义肢刺入控制台，他的意识顺着数据流冲向核心。小雨的声音突然在意识深处响起：“哥，记得父亲说过的‘共振谐波’吗？用原住民额头的晶体作为增幅器！”
陈默转头看向地面，那些原住民因孢子舱的侵蚀痛苦挣扎，他们额头的晶体正逐渐黯淡。他冒险将星舰的能量分出一缕，注入最近的晶体。奇迹发生了，晶体爆发出耀眼的白光，与狄俄涅核心形成共振，紫色牢笼开始崩解。
“不可能！”零号的全息投影扭曲变形，“你们怎么会知道古代契约的破解方法？”他的钻探舰启动自爆程序，血月棱镜碎片脱离舰体，悬浮在液态金属海洋上方，开始吸收星球的能量。陈默看到，金属海洋中浮现出巨大的骸骨——那是被深潜者毁灭的前文明遗迹，每根骨刺上都刻满与父亲日志相同的符文。
当星舰终于突破封锁降落在水晶森林边缘时，陈默的意识重新凝聚成实体。他在废墟中找到母亲遗留的完整水晶，上面的星舰图案突然亮起，投射出全息地图：在双色地貌的交界处，隐藏着蓝星文明的核心——一座由光与暗交织而成的星门。而此时，零号已经带着孢子舱抵达星门，准备将深潜者的污染扩散到整个银河系。
“保护星门！”陈默冲向最近的原住民，将能量注入他们的晶体武器，“深潜者会吞噬你们的灵魂！”原住民们眼中的敌意消失，他们举起发光的长矛，与陈默并肩对抗孢子舱孵化出的机械怪物。战斗中，陈默发现这些怪物的弱点竟是对光的恐惧——就像地球的丧尸畏惧阳光。
星门开始不稳定地闪烁，零号的身影出现在光芒中，他的身体正在被血月棱镜碎片同化，背后长出布满眼睛的触手。“加入我们，成为新文明的主宰。”他的声音同时在所有人意识中响起，“否则，这颗星球将成为第二个地球。”
陈默握紧母亲的水晶，将其嵌入星舰的能量槽。狄俄涅核心爆发出前所未有的强光，所有孢子舱在光芒中化为灰烬。零号发出不甘的怒吼，他的身体被光与暗撕扯成碎片，但在消散前，他将血月棱镜碎片投入星门，碎片的紫光顺着星门的纹路扩散到未知的星系。
战斗结束后，蓝星的原住民将陈默带到星门核心。他们额头的晶体组成巨大的矩阵，投射出一段影像：二十年前，母亲作为人类代表来到蓝星，试图阻止深潜者的阴谋，却被原住民误解。而父亲在地球的所有研究，都是为了找到激活星舰、穿越星门的方法。
“我们错了。”原住民首领将一枚发光的晶体交给陈默，“这是开启星门的密钥。深潜者的污染已经扩散到十三个星系，你们必须找到‘银河方舟’的其他碎片。”
星舰重新升空时，陈默望着双色地貌逐渐缩小的蓝星。他的机械义肢与星舰融合处，浮现出母亲水晶上的星舰图案。在遥远的某个星系，被血月棱镜碎片污染的星球正在扭曲变形，而在银河系的另一端，装载着人类幸存者的殖民舰，正朝着陈默发送的坐标全速前进。