清光绪十年（1884年）正月初十，岑毓英离开镇南关，前往兴化，负责节制边外各路军队，以加强边疆防御。
二月初一，法国人进攻兴化，当地官军奋起抵抗，成功击退敌军。岑毓英与徐延旭随后谋划进军山西，朝廷特别下达谕令，要求军队严格约束，不得侵扰越南边境。为了赈济受灾百姓，朝廷留下江浙漕米各五万石，用于救助通州、天津遭受水灾的民众，不久后，又从京仓调拨粟米三万石，赈济顺天受灾百姓。二月初十，法国人攻陷北宁，官军被迫退守太原。二月二十九，朝廷命令湖南巡抚潘鼎新前往广西筹备防务。二月最后一天，法国人攻陷太原，徐延旭、唐炯因此被撤职并逮捕审问。
三月初九，岑毓英请求免除自己节制楚、粤诸军的职务，朝廷没有批准。因为太原失陷，提督黄桂兰、道员赵沃也被撤职逮捕审问。三月初十，慈禧太后下懿旨，以因循贻误为由，让军机大臣恭亲王奕訢回家养病，大学士宝鋆按原品级退休，协办大学士李鸿藻、景廉均降二级，工部尚书翁同龢被撤职但仍留任。同时任命礼亲王世铎，户部尚书额勒和布、阎敬铭，刑部尚书张之万为军机大臣，工部侍郎孙毓汶进入军机处学习任职。三月十一，太后懿旨规定，军机处遇到重要事情，要会同醇亲王商量后再施行。三月十四，朝廷授予潘鼎新广西巡抚一职，张凯嵩任云南巡抚。总兵陈得贵因失守炮台，副将党敏宣临阵退缩，均被下令在军前斩首。朝廷任命怡亲王载敦为阅兵大臣，命贝勒奕劻管理总理各国事务衙门，内阁学士周德润在该衙门任职。三月十五，左庶子盛昱、右庶子锡钧、御史赵尔巽各自上疏，认为醇亲王不应参与机务，但朝廷没有回应。朝廷任命刑部侍郎许庚身在军机处学习任职。三月十六，朝廷下诏，让李鸿章、左宗棠、曾国荃、岑毓英举荐部下中沉着坚毅、勇敢且有谋略的将领。三月二十一，阎敬铭、许庚身一同在总理各国事务衙门任职。朝廷命潘鼎新前往镇南关接管徐延旭的军队。三月二十二，法国人进占兴化。这个春天，朝廷还免除了仁和荒芜灶荡上年的逋课，陕西咸宁等处的逋赋及杂欠，以及穆坪土司马匹粮草十年的赋税。
四月，新疆南部边界勘察划分工作完成。侍讲许景澄被任命为出使法德义和奥大臣。此前，法越战事紧急，法国水师将领福禄诺通过税务司德璀琳提议媾和息兵，李鸿章将此事上报朝廷，获得许可后，奉命筹划相关事宜。此时，李鸿章上奏表示应“审时度势，权衡力量，谨慎稳重，等待时机”。朝廷召集大臣商议，太后懿旨让醇亲王也参与讨论，并允许吴长庆的军队撤回。四月初九，利津等地决口的河堤合拢。四月十一，朝廷决定停止开挖马颊河，改为疏浚宣惠河，并修建德州运河堤坝。四月十六，朝廷任命通政使吴大澂协助办理北洋事务，内阁学士陈宝琛协助办理南洋事务，侍讲学士张佩纶协助办理福建海疆事务，且都允许他们直接上奏。不久后，张佩纶被加授三品卿衔。福禄诺提出五条私下的议和条款，由李鸿章上报朝廷。朝廷敕令李鸿章“全力杜绝对方的狡猾阴谋，时刻保持警惕”，同时下诏让户部裁减不必要的开支。四月十八，朝廷授予李鸿章全权大臣之职，与法国使者商议和约。四月二十，朝廷免除褒城临江地区的田赋。四月二十二，举行祈雨仪式。四月二十三，再次发放仓米赈济顺天百姓。四月二十五，吴大澂辞去北洋会办一职，皇帝斥责他借口推辞，没有批准。四月二十九，张树声因为生病请求免去本职，只负责军事事务，朝廷同意了他的请求。
五月初一，朝廷任命李成谋统领江南兵轮。五月初四，岑毓英辞去节制粤、楚各军的职务，朝廷批准了他的请求。五月十二，朝廷授予文煜武英殿大学士。五月十三，额勒和布、阎敬铭均以户部尚书的身份协办大学士。五月十四，由于京师久旱，朝廷谕令有关部门平价出售粮食。朝廷赏赐徽宁太广道张荫桓三品卿衔，让他在总理各国事务衙门学习任职。五月十六，朝廷下诏，让朝廷内外举荐文武人才。五月十九，朝廷下诏，因为皇太后五十大寿，停止秋季的死刑处决。五月二十二，朝廷下诏，要求朝廷内外大臣“率领下属尽职尽责，不要沉迷享乐、崇尚浮华”。五月二十三，朝廷下诏，左宗棠仍担任军机大臣，但不必经常到岗值班，同时管理神机营。朝廷免除武昌、黄州二卫的额粮。五月二十七，朝廷下诏，举荐宗室以及旗人、汉人中有世袭职位的人才。
闰五月初一，朝廷任命工部尚书福锟、理藩院尚书昆冈、左都御史锡珍、工部侍郎徐用仪、内阁学士廖寿恒一同在总理各国事务衙门任职。闰五月初三，朝廷任命前提督刘铭传督办台湾事务，锡珍、廖寿恒、陈宝琛、吴大澂前往天津商议与法国的和约。闰五月初六，朝廷命令太常卿徐树铭勘察献县新开的横河。法国人进犯观音桥，被潘鼎新击败。闰五月初七，山东河堤工程完工。闰五月初十，因为法国使者表示愿意议和，朝廷调潘鼎新的各路军队回到谅山，岑毓英的军队仍然驻扎在保胜。闰五月十一，从四月开始就没有下雨，到这一天终于降雨。朝廷颁布确定免除和缓征钱粮的章程。闰五月十六，思恩的土匪首领莫梦弼被处死。闰五月二十二，法国军舰进犯闽海。闰五月二十三，朝廷谕令：“法国使者拖延不商议和约，孤拔的要求毫无道理，我军应当严阵以待。如果他们胆敢进犯，就合力攻击。有敢退缩的人，立刻按军法处置。”闰五月二十六，朝廷授予曾国荃全权大臣之职，让他与法国使者在上海商议和约，命令陈宝琛协助办理。
六月初一，因为郧西余琼芳案件审判结果不符合事实，朝廷将总督卞宝第、巡抚彭祖贤交予相关部门讨论处理，负责审理的各级官员也分别受到贬斥。六月初二，黄河在历城等县决口。因为曾在危难中求援并坚守城池，朝廷追封沈葆桢的妻子林氏，让她附祀在广信沈葆桢的专祠中。六月初四，建昌、多伦的土匪首领杨长清被处死。六月初五，吴长庆去世，朝廷表彰他的儿子主事吴保初的孝行。六月初七，朝廷谕令各直省考察州县官员。六月二十，法国人攻陷基隆。朝廷下诏召集大臣商议是战是和。六月二十三，刘铭传收复基隆。六月二十七，太后懿旨，神机营挑选三千名马步军，巡捕五营挑选二千名练军，任命都统善庆为总统，前锋统领托伦布为帮统，分别防守京城东部，并抽调直隶的练军协助防守。朝廷命令曾国荃、陈宝琛返回江宁布置防务。这个月，朝廷赈济顺德、青浦的风灾，以及叶县的水灾。
秋七月初二，朝廷命令吴元炳勘察山东的河工与海防情况。朝廷授予张之洞两广总督一职。七月初三，法国人袭击马尾炮台及船厂，陆军将其击退。七月初五，醇亲王上奏弹劾延煦弹劾左宗棠的行为，斥责延煦蔑视礼仪、对朝廷不忠，随意胡乱陈奏，颠倒黑白。太后懿旨判定延煦撤职留任，罚俸一年。朝廷下诏与法国人宣战，命令杨昌濬前往福建督率军队。七月初十，法国人毁坏长门炮台。七月十四，朝廷谕令穆图善、张佩纶不要退守省城。朝廷下诏授予左宗棠钦差大臣之职，督办福建军务，福州将军穆图善、漕运总督杨昌濬为副手，张佩纶以会办大臣的身份兼任船政大臣。朝廷授予曾国荃两江总督，兼任南洋大臣。七月二十三，朝廷追究北宁失守的罪责，已被革职的道员赵沃、提督陈朝纲均被判处斩首。七月二十五，朝廷任命杨昌濬为闽浙总督。朝廷普遍赈济历城等县的灾民。这个月，朝廷还赈济了浮梁以及齐河、长安等地的水灾。
八月初三，朝廷任命鸿胪寺卿邓承修在总理各国事务衙门任职。马尾战事功过评定后，何璟被革职，张佩纶被削去卿衔，交由相关部门审议；提督黄超群等有功将士则获赏或晋升。与此同时，建宁、邵武的土匪首领张廷源等人被诛杀。八月初五，黄河在东明决口，南海等县遭受水灾，朝廷随即展开赈济工作。八月初七，李鸿章被授予直隶总督、北洋大臣之职。八月初九，太后懿旨，赏醇亲王子载沣不入八分辅国公。文煜因病免职，崇厚、崇礼、文锡、文铦被命出资助饷。八月十一，朝廷赈济遭受风灾的台湾民众。八月十八，法军再度攻陷基隆。八月十九，道员徐承祖被任命为出使日本大臣。八月二十，朝廷下诏，刑部当年情节严重案件及秋、朝审官犯案，均暂停查办。八月二十四，苏元春在陆岸与法军交战并取胜，杨岳斌被命帮办左宗棠军务，星子水灾也得到赈济。八月二十九，法军进犯沪尾，提督孙开华率部将其击退。
九月初五，唐炯被逮捕入狱，接受朝廷审讯。九月初七，朝廷拨出五万两库银赏赐刘永福的军队。九月十三，朝廷严令南北洋轮船全力支援台湾。九月十四，刘铭传任福建巡抚，驻守台湾督防；苏元春帮办潘鼎新军务；杨昌濬等人分防澎湖；张兆栋、何如璋被革职。朝廷还下诏，云南田税，暂荒之地缓征三年，永荒之地免征十年。九月十六，刘铭传因战事不利自请治罪，获朝廷赦免。九月二十，朝廷截留十万石新漕粮，为山东冬季赈灾做准备。九月二十二，因沪尾之战告捷，总兵孙开华获世袭官职，朝廷拨银一万两犒赏军队。同日，额勒和布被授予体仁阁大学士，恩承以刑部尚书身份协办大学士。九月二十七，凤凰城遭受水灾，朝廷予以赈济。九月二十九，官军在陆岸再败法军，苏元春获世袭官职。九月三十，新疆改建行省，设置巡抚、布政使各一名，裁撤南北路都统、参赞、办事、领队等职务。
冬十月初一，太后懿旨，晋封奕劻为庆郡王，奕谟为固山贝子。十月初二，刘锦棠任甘肃新疆巡抚。十月初七，江北厅等地遭受水灾、雹灾，朝廷进行赈济。十月初十，太后五十大寿，光绪帝率领亲王以下文武大臣到慈宁宫庆贺。十月二十，鲍超多次延误行军日期，遭朝廷严厉斥责。十月二十二，提督王洪顺因托病逃避军务被革职。十月二十三，张树声去世。十月二十四，朝鲜再次发生动乱，吴大澂前往调查处理，续昌为副手。同日，文煜去世。十月二十九，刘永福在宣光与法军交战，遭遇失败。
十一月初七，朝廷任命提督孙开华帮办台湾军务。十一月初八，徐延旭被逮捕入狱受审。十一月十二，李鸿章调派军队前往朝鲜。十一月十三，普洱发生地震。十一月十六，朝廷禁止州县虚报灾荒。十一月十七，东明决口成功合拢。十一月十八，李秉衡前往龙州部署防军。十一月十九，朝廷举行祈雪仪式，云南巴蛮归降。十一月二十八，朝廷下令各省储备粮食。
十二月初九，官军在纸作社击败法军。十二月十三，唐炯、徐延旭被判处斩首。十二月十六，官军收复宣光、兴化、山西三省，以及安平府和二州五县。十二月二十三，禄劝的夷族土匪被平定。十二月二十七，天降雨雪。张佩纶、何如璋被革职并流放。
这一年，朝廷免除镇西厅荒地拖欠的赋税，以及文安等四州县涝地的定额赋税。朝鲜前来进贡。越南国王阮膺登自杀，法国人扶持其弟成为新国王。
清光绪十一年（1885年）农历正月初一，朝廷任命冯子材协助办理广西关外的军务。正月初三，法国人攻陷谅山，局势变得愈发紧张。正月初四，官军包围宣光，并收复美良城，给清军带来一丝振奋。正月十二，法军进犯镇南关，总兵杨玉科在战斗中不幸牺牲，令人痛心。正月十三，朝廷赐予英国将领戈登抚恤金，以肯定其过往贡献。正月二十二，法国军舰撤离台湾，左宗棠等人派兵支援浙江，加强沿海防御。正月二十三，朝廷任命李鸿章为全权大臣，偕同吴大澂与日本使者商议朝鲜相关事宜。正月二十八，朝鲜内乱被平定，朝鲜派使者前来表达谢意，朝廷也给予了赏赐。
二月初一，浙江提督欧阳利见在镇海口击败法军，有力地捍卫了沿海地区。二月初五，潘鼎新因战事不利被革职，朝廷任命李秉衡代理广西巡抚，苏元春督办广西军务。二月初八，秦州发生地震，百姓生活受到影响。二月初十，冯子材、王孝祺在镇南关外大败法军，并成功收复谅山，杨玉科等阵亡将士也被赐予世袭官职，以表彰他们的英勇。二月十八，法国提出求和，朝廷予以应允。二月十九，朝廷下诏停战并撤兵，与此同时，缅甸的匪患也被平定。二月二十五，岑毓英上奏称官军在临洮取得大捷。
三月初二，朝廷任命李鸿章为全权大臣，与法国使者商议和约，刑部尚书锡珍、鸿胪卿邓承修前往天津参与会商。三月初三，与朝鲜的条约签订完成。三月初七，岑毓英收复缅旺以及清水、清山等寨子，并抓获越南叛臣黄协等人将其诛杀。三月初十，朝廷命令吴大澂、依克唐阿共同勘察吉林东部边界。三月十三，朝廷免除永平、张家口、顺天等十府州多年来百姓拖欠的租赋，减轻民众负担。三月二十，朝廷任命冯子材督办钦州、廉州的防务。三月二十二，朝廷免除陕西咸宁等地前年拖欠的粮食赋税。
夏季四月，天气干旱，朝廷举行祈雨仪式。四月初九，朝廷催促岑毓英撤军，强调不要违背约定引发冲突。四月十四，朝廷下令革除江西丁漕方面长期存在的积弊。四月十五，朝廷催促刘永福撤回驻守保胜的军队。在天津，中法新约签订完成，持续已久的中法纷争暂时告一段落。
五月，太后下旨勘察修建南北海工程。朝廷下诏整顿海军，大力发展水师，并让南北洋大臣等人进行筹划。基隆的法军撤退后，朝廷命令杨岳斌等人部署台湾的各项事务。朝廷免除福建光绪初年拖欠的赋税，减轻当地百姓的经济压力。五月初七，朝廷允许乍丫跟随察木多一同前来进贡。五月初九，朝廷赐予苏元春、冯子材三等轻车都尉的爵位，赐予王孝祺、岑毓英云骑尉的爵位，恢复王德榜原有的官职并给予优等奖励。五月十七，朝廷再次举行祈雨仪式，第二天便降下雨水，缓解了旱情。五月二十二，朝廷任命张曜为广西巡抚。这个月，朝廷还对基隆遭受兵灾、桐城等县以及镇筸遭受水灾的民众进行了赈济，帮助受灾百姓渡过难关。
六月，朝廷下诏停止秋季的死刑处决。太后下旨，命令文铦、崇礼、崇厚、文锡负责修建三海工程。许景澄兼任出使比利时大臣。朝廷确定内附越南民众的户籍。曾纪泽与英国签订的烟台条约完成。朝廷下令让岑毓英考察云南的铜矿，同时通知曾国荃等人勘察东南地区的各类矿产。朝廷赈济裕州遭受水灾的民众。六月十四，朝廷任命工部侍郎孙毓汶、顺天府尹沈秉成、湖南按察使续昌在总理各国事务衙门任职。朝廷召回曾纪泽，任命江西布政使刘瑞芬为出使英国、俄国大臣，张荫桓为出使美国、日本、秘鲁大臣。法国军队撤离澎湖后，朝廷命令左宗棠等人挑选将领、调配轮船进行策应。六月二十四，与越南的新约签订完成，并向国内外宣布。朝廷下诏告诫建言的大臣们不要心怀私心进行攻击，随后追究御史吴峋弹劾阎敬铭、编修梁鼎芬弹劾李鸿章的责任，认为他们是在诬谤大臣，给予严厉处分，不久后二人各降五级官职。六月二十七日，朝廷授予孙毓汶军机大臣的职务。这个月，朝廷对河南、广东、广西、江南、安徽、江西等地遭受水灾的民众进行了赈济。
秋季七月初一，朝廷在广西南宁架设电线，连通云南，加强了地区间的通讯联系。七月初三，太后下旨拨出六万两库银赈济两广地区遭受水灾的民众。七月初四，左宗棠多次请求因病辞职，朝廷批准了他的请求。七月二十，朝廷命令周德润前往云南，邓承修前往广西，会同岑毓英、张凯嵩勘察中国与越南的边界。七月二十六，黄河在山东长清决口，给当地带来灾害。七月二十八，朝廷下令开采四川、云南的铜铁矿，以促进经济发展。这个月，朝廷还对黔阳、湘潭、辉县、清江、当涂、汾阳等地遭受水灾的民众进行了赈济。
八月初一，朝廷赈济奉天遭受水灾的民众。八月初三，朝廷截留十万石漕粮，作为顺天府和直隶地区的赈济物资。朝廷还赈济皋兰等地遭受雹灾和水灾的民众。八月初九，朝廷赈济长沙等地遭受水灾的民众。八月十一，山东历城、章丘等地发生水灾，朝廷拨出五万两库银进行赈济。由于多地发生水灾，朝廷下令暂停三海工程的建设。李鸿章与法国使者商议滇、粤陆路通商事宜。八月十二，朝廷释放李昰应，让他返回朝鲜。八月十五，朝廷命令苏元春安抚从越南入关的流民。朝廷赈济襄城遭受水灾的民众。八月十九，左宗棠去世，朝廷追赠他为太傅，以缅怀他的功绩。八月二十五，朝廷赈济福建遭受风灾的民众。
九月，太后下旨，任命醇亲王总理海军事务，奕劻、李鸿章协助办理，汉军都统善庆、兵部侍郎曾纪泽帮忙办理。朝廷将福建巡抚改为台湾巡抚，将原来福建巡抚的事务归由闽浙总督管理。英国使者前来商议印度与西藏通商的事宜，朝廷命令丁宝桢、色楞额等人开导西藏番民，避免发生事端。九月初三，灵桂去世。九月初五，朝廷裁撤伊犁参赞大臣一职，改设两名副都统；裁撤塔尔巴哈台满洲领队大臣，保留额鲁特领队大臣。九月十五，朝廷赈济宾川、恩安等地遭受雹灾的民众。
冬季十月初一，朝鲜国王李熙因国内潜藏的匪患尚未清除，请求清朝派兵镇压安抚，李鸿章派遣军队前往朝鲜进行防卫。十月初三，朝廷赈济朝阳遭受灾害的民众。十月十五，朝廷截留来年的五万两京饷银，作为山东冬季的赈济物资。十月十六，朝廷命令奕劻、许庚身与法国使者互换条约，刘瑞芬在英国伦敦互换烟台条约，并商议洋药专条。十月二十二，朝廷任命穆图善为钦差大臣，会同东三省将军办理练兵事务，并节制副都统以下官员。十月二十九，朝廷拨出五万两过年用的宫中银钱，赈济山东灾区。同时，朝廷加强了紫禁城的门禁管理。
十一月，朝廷举行祈雪仪式。十一月初四，云南发生地震。十一月十九，朝廷裁撤新疆各城的回官。十一月二十二，太后下旨，要求八旗都统整顿旗营中存在的各种弊端。朝廷授予恩承体仁阁大学士，阎敬铭东阁大学士，户部尚书福锟、刑部尚书张之万均协办大学士。由于英国灭掉缅甸，朝廷加强四川的边防戒备。
十二月初一，朝廷继续架设三姓、黑龙江的陆路电线。十二月十一，朝廷下诏命令内务府禁止奢侈浪费、虚报冒领。十二月十四，赵庄决口成功合拢。
这年冬天，朝廷赈济潮州、万县遭受水灾，台湾遭受风灾的民众。朝廷免除永宁遭受水灾地区的丁银，浙江各州县卫荒废土地和新种土地的赋税。朝廷减少文安、天津洼地的粮食赋税，免除徐沟、汾阳遭受灾害地区的银税，通过一系列措施减轻民众负担，帮助受灾地区恢复生产生活。
清光绪十二年（1886年）农历正月初一，朝廷停止举办筵宴活动。正月初六，朝廷下令免除湖北拖欠的赋税，减轻当地百姓负担。正月初七，山东溞沟决口成功合拢，解决了一处水患危机。朝廷同时免除了台湾以往拖欠的供粟。正月初九，奇台因遭受旱灾，其应缴纳的定额赋税也被免除。正月二十二，朝廷命令特尔庆阿等人跟随穆图善参与练兵事务，以加强军事力量。正月三十，皇帝下诏，因要前往谒陵，将本年会试日期改为三月十日入场。
二月初一，山东黄河南岸出现决口。二月初十，张曜前往勘察何王庄决口情况。二月十五，朝廷免除溆浦多年来因遭受水灾而应缴纳的定额赋税。二月二十四，朝廷在黑龙江设立绥化厅，完善地方行政建制。二月二十七，光绪皇帝侍奉皇太后前往谒东陵，为减轻百姓负担，免除了皇帝一行经过州县十分之四的税粮。
三月初二，皇帝拜谒各座皇陵，并前往定东陵。三月初七，皇帝结束谒陵行程返回。三月二十，朝廷赈济广宁受灾民众。这个月，朝廷截留山东新漕粮十万石，用来赈济何王庄以及章丘、济阳、惠民等地遭受水灾的百姓。
四月，朝廷赐赵以炯等三百三十九人不同等级的进士及第或出身。同月，丘北发生地震，广西州发生火灾，朝廷及时对受灾地区进行了赈济，帮助当地民众渡过难关。
五月初七，台湾有四百余社的生番归顺，人数多达七万余人。朝廷赈济临潼等县遭受风雹灾害的民众。五月初九，朝廷裁撤阳江镇水师总兵一职，设置北海镇水陆总兵，并将高州镇陆路总兵改为水陆总兵，对地方军事建制进行调整。
六月初十，太后下旨，让钦天监在明年正月为皇帝亲政选择合适日期。六月十二，朝廷修复海盐石塘，加强沿海防护。六月十四，醇亲王及王大臣等联名上疏，请求皇太后继续训政，但被太后拒绝，并确定皇帝于明年正月十五日亲政，同时命令枢臣共同商议，整顿货币制度。六月二十，醇亲王和礼亲王等人再次请求皇太后训政，尚书锡珍、御史贵贤也纷纷进言，太后最终勉强同意，并命醇亲王继续处理各项事务。
七月初一，木邦土司请求归附清朝，朝廷没有接受。七月初四，金顺去世。七月初八，朝廷截留江苏漕米五万石，以备顺天府、保定府的赈济之需。七月十二，钱法议定后上奏朝廷，并获批准施行。七月二十一，朝廷赈济太原等县遭受水灾的民众。
八月初一，朝廷任命色楞额为伊犁将军。同时，赈济热河遭受水灾的民众。八月初四，礼亲王及朝中大臣请求为皇太后加上徽号，太后下旨不允许。八月初六，朝廷再次拨出江北漕米五万石，赈济顺天通州遭受水灾的民众，还发放帑金二万两救济灾民。朝廷免除陕西咸宁等地荒田拖欠的赋税。八月初七，由于北运河决口导致河水漫溢，朝廷拨出库帑十万两作为永平各府的紧急赈济款，又拿出内帑二万两进行补充。八月十五，朝廷增设广西太平归顺道，将提督驻地迁至龙州，并增设柳庆镇总兵，驻守柳州。八月二十，朝廷修筑怀柔白河决口处。八月二十五，御史朱一新上奏，提出遇到灾害应反思自省，要预防宦官专权等弊端。他提到醇亲王巡阅北洋时，总管太监李莲英随行，担心会重蹈唐代监军的覆辙。太后下旨让朱一新回奏，不久朱一新奏上，因其言论固执荒谬，被降为主事。
九月初一，朝廷赈济奉天、浙江遭受水灾的民众。九月初三，朝廷赈济甘肃遭受雹灾和水灾的民众，以及留壩、南郑遭受水灾的民众。九月初七，因顺天和直隶发生水灾，朝廷减少各府各旗庄田的租额及其他赋税额度。九月初十，鲍超去世。九月十五，朝廷赈济光山遭受雹灾的民众。九月十六，刘铭传率军剿灭苏鲁马那邦叛乱的番民。九月二十四，朝廷赈济上饶等县遭受水灾的民众。
十一月初一，寿张决口成功合拢。十一月十六，朝廷赦免徐延旭、唐炯的罪行，徐延旭被发配到新疆戍边，唐炯被发配到云南戍边。十一月十八，朝廷任命曾纪泽在总理各国事务衙门任职。十一月二十一，朝廷再次拨出京仓粟米三万石，以备顺天来年春季的赈济之需。十一月二十七，冬至日，光绪皇帝首次亲自前往圜丘祭祀上天。朝廷免除隆科城的定额赋税。
十二月初五，朝廷减少安州、河间、隆平水涝之地的粮食赋税。十二月初八，朝廷举行祈雪仪式。十二月二十一，太后再次下旨，敕令曾国荃等人详细商议两江河道的治理办法。十二月二十八，朝廷在太庙举行合祭大典。
这一年，朝鲜前来进贡，延续着与清朝的宗藩关系。
清光绪十三年（1887年）正月初一，朝廷按惯例停止举办筵宴活动。正月十三，光绪皇帝为即将亲政，派遣官员祭告天地、宗庙、社稷，并向上帝祈求五谷丰登。正月十五，光绪皇帝正式开始亲政，向天下颁布诏书，广泛施恩，不同群体得到相应的恩典。正月二十四，朝廷调拨江苏漕米十万石，用于赈济顺天和直隶地区的灾民。太后下旨，在天津购置机器铸造钱币，规定每一文钱重量以一钱为标准，要求京城内外铸造钱币的规格不得有差异。
二月初二，天空降下雨雪。二月十二，朝廷斥责恭镗，要求他严厉剿灭马贼，并整顿现有的练军。四川与云南连接的电线铺设完成，改善了两地的通讯状况。二月十九，皇帝祭祀大社、大稷。三月初五，朝廷赏赐唐炯巡抚衔，命他督办云南矿务。这个月，太后下旨，醇亲王的亲王爵位世袭罔替，国家重大政事仍要向他咨询请教。
三月初一，光绪皇帝首次前往奉先殿行礼。三月初七，光绪皇帝侍奉皇太后前往拜谒西陵，为减轻百姓负担，免除了皇帝一行经过州县十分之三的定额赋税。三月十一，皇帝拜谒皇陵。三月十六，皇帝结束谒陵行程返回。三月二十三，皇帝祭祀先农，并亲自在耤田耕作，完成三推之礼后又多加一推，此后每年都按此惯例进行。三月二十八，刘锦棠请求解除职务回家探亲并就医，朝廷没有批准，只给了他三个月假期，让他在任上调理身体。朝廷拨出直隶藩库银八万两，赈济辖区内的饥民，并免除文安等地没有收成土地的地租。
四月初一，皇帝祭祀太庙。四月初十，朝廷任命内阁侍读学士林维源督办台湾铁路及商务事宜。四月十二，因天气干旱，朝廷举行祈雨仪式。四月十九，举行常雩祭祀，皇帝在圜丘祭祀上天。
闰四月十四，朝廷免除江苏各州县卫拖欠的赋税和课税。闰四月十七，朝廷赈济昆明等县遭受水灾的民众。
五月初一，夏至日，皇帝在方泽祭祀地神。五月初二，朝廷任命前内阁学士洪钧为出使俄、德、奥、和（荷兰）大臣，大理卿刘瑞芬为出使英、法、义（意大利）、比大臣。五月二十六，朝廷赈济陇州等地遭受水灾的民众。五月二十七，终于降下雨水。
六月初一，朝廷赈济富阳等地遭受水灾的民众。六月十八，朝廷赈济怀宁等县遭受水灾的民众。六月二十，开州大辛庄的河水泛滥，淹没山东部分地区，朝廷截留新漕粮五万石，赈济濮州等地的灾民。六月二十三，朝廷赈济罗田、石首遭受水灾的民众。六月二十五，朝廷赈济温宿、乌什遭受水灾的民众。六月二十六，朝廷赈济凌云遭受风雹灾害的民众。
七月初一，发生日食现象。七月初五，永定河、潮白河先后河水泛滥。七月初九，朝廷增设福建澎湖镇总兵，加强澎湖地区的军事力量。七月初十，朝廷赈济南阳等地遭受水灾的民众。七月十二，朝廷免除甘肃多年来百姓拖欠的银钱、粮食以及各种杂赋，并赈济洮州等地遭受雹灾的民众。七月二十，朝廷增设云南临安开广道。七月二十二，黎民的匪患被平定。七月二十六，朝廷任命道员黎庶昌为出使日本大臣。
八月初二，皇帝祭祀大社、大稷。八月十八，沁河决口。朝廷赈济平彝遭受水灾的民众。八月二十，沔阳等州县被洪水淹没，朝廷截留冬季漕粮三万石进行赈济。郑州黄河决口，河水向南流入淮河，河道总督成孚被革职，但仍留任处理相关事务。八月二十三，朝廷调拨京仓漕米五万石，赈济顺天通州所属地区的灾民。截留京饷漕折银三十万两，赈济河南受灾民众。八月二十七，太后下旨，拿出内库银十万两，赈济遭受水灾的百姓。
九月初一，朝廷免除陕西各府厅州县前年拖欠的赋税。九月初七，因郑州黄河决口，朝廷预先留存明年江北、江苏河运的米粮及运费，用于赈济灾民。九月十七，朝廷准许哷徵胡图克图前来进贡。九月二十一，朝廷命薛允升前往河南勘察郑州黄河决口工程情况。九月二十三，李鸿藻前往河南，会同勘察河工。这个月，朝廷赈济武陟、安县、云阳、皖北等地遭受水灾的民众，以及汉口、龙州遭受水灾，建水、通海遭受雹灾的民众。
十月初一，朝廷赈济融县遭受火灾的民众。十月初四，冯子材因患病请求辞职，朝廷命他留驻广东办理钦州、廉州防务。冯子材再次请求退休，朝廷没有批准。十月初六，朝廷赈济惠州、高州、廉州、雷州、琼州、赤溪、阳江遭受风灾的民众。十月十六，穆图善去世。朝廷向郑州等灾区的贫民发放口粮。十月十九，朝廷任命善庆为福州将军，协助办理海军事务，并管理神机营。朝廷免除顺天和直隶遭受水灾各州县的秋赋。十月二十二，朝廷赈济镇西厅遭受雪灾的民众。十月二十五，光绪皇帝侍奉皇太后探视醇亲王病情，此后频繁探视，直到第二年七月醇亲王病愈。十月二十七，朝廷赈济长安等地遭受水灾的民众。十月三十，朝廷赈济绥来遭受霜灾的民众。
十一月初二，朝廷授予定安钦差大臣，命他会同东三省将军办理练兵事务，并节制副都统以下官员。十一月初八，冬至日，皇帝在圜丘祭祀上天。十一月初九，朝廷谕令文硕寻访呼毕勒罕，并按照制度进行掣定。十一月十九，朝廷举行祈雪仪式。
十二月初五，朝廷命李鸿藻督办郑州黄河决口工程。十二月初七，朝廷免除恩隆、百色等地荒田的定额赋税。朝廷赈济桂林等地遭受火灾的民众。十二月初十，朝廷免除阳城等县因灾缓缴的税租。十二月十五，天空降下雨雪。十二月十六，太后下旨，恢复阎敬铭、福锟、翁同龢、嵩申、孙诒经、景善、孙家鼐等人之前被处分的职务。十二月十八，因皖北受灾，朝廷调拨安徽漕折银和芜湖关常税银共十万两，以备来年春季赈济之需。十二月十九，朝廷在新疆设置伊塔道、伊犁府、霍尔果斯厅、塔城厅，并设立道员、知府、抚民通判、同知等官职。十二月二十，石屏、建水发生地震。十二月二十七，朝廷调拨山东冬季漕粮五万石，以备河南来年冬季赈济之用。
这一年，朝鲜按照惯例前来进贡，维系着与清朝的宗藩关系。
清光绪十四年（1888年）正月初一，光绪皇帝亲自前往堂子行礼，开启新一年的祭祀仪式。正月初四，天降大雪，给大地带来湿润气息。朝廷免除安徽被淹的太和等州县的夏粮赋税，减轻受灾百姓负担。正月初七，黑龙江漠河金矿正式开采，为国家经济发展注入新资源；次日，广东昌化石绿铜矿也开始开采。正月初九，腾越至云南省垣的电线得以展接，改善了地区间通讯条件。正月二十三，刘锦棠因病请求休假，朝廷好言慰留，并再次给予他四个月假期。正月三十，朝廷下令，铸造的当十大钱，每文重量在二钱以上的，一律允许流通使用。当月，朝廷拨留京仓及海运漕米共计十三万石，用来赈济顺天、直隶受灾民众。
二月初三，梧州发生火灾，朝廷迅速开展赈济工作。二月初四，裴荫森获赏三品京堂，受命督办福建船政，肩负起船政建设重任。二月初八，文硕因擅自将密疏稿递交都察院，被革除职务。二月二十九，皇帝祭祀先农，并亲耕耤田。本月，朝廷下诏修葺颐和园，为皇太后日后临幸做准备。
三月初五，朝廷免除浙江光绪五年以前拖欠的赋税。三月十五，朝廷赏赐班禅额尔德尼转世呼毕勒罕哈达、念珠、如意等礼品。
四月初九，永定河决口成功合拢，解决了一大水患。四月初十，光绪皇帝侍奉皇太后首次前往西苑。四月十三，广东电线从九江展接到大庾岭，进一步完善通讯网络。四月十六，部分地区降下冰雹。四月三十，朝廷任命张曜帮办海军事务，同时赈济惠州等遭受水灾的地区。
五月初五，京师、奉天、山东等地发生地震，引发社会关注。五月十三，夏至日，皇帝在方泽祭祀地神。五月十七，因天气干旱，朝廷举行祈雨仪式。
六月初九，终于降下雨水。六月十五，太后下旨，皇帝大婚典礼定在明年正月举行。六月二十，彭玉麟因病免去兵部尚书一职，但仍继续负责巡阅长江水师。六月十八，太后下旨，宣布明年二月初三正式归政。
七月初七，因河工出现贻误，李鸿藻、倪文蔚被革职但仍留任，李鹤年、成孚则被发配到军台效力。七月十一，永定河再次决口。七月十三，阎敬铭被罢官。七月二十四，朝廷谕令吴大澂勘察核实河工情况。当月，津沽铁路建成通车，为交通带来便利。
八月初五，朝廷赈济奉天各厅州县以及安徽怀宁等县遭受水灾的民众。八月初七，朝廷下诏要求各直省清理积压的案件。八月初十，朝廷赈济苍梧等地遭受水灾的民众。八月十五，朝廷截留江北漕米，以备江苏、安徽地区的赈济需求。八月二十三，醇亲王因归政日期临近，请求解除职务。太后下旨，海军署、神机营仍由醇亲王照旧管理，归政后奏事无需列其名衔。
九月初五，朝廷免除陕西去年拖欠的赋税。九月二十三，永定河决口再次合拢。
十月初一，皇帝祭祀太庙。十月初五，太后下旨立叶赫那拉氏为皇后。十月十五，朝廷调拨二万石京漕米，作为顺天冬季赈济物资。十月十六，朝廷免除水城等地的丁粮赋税，同时赈济丹徒遭受旱灾、南昌等县遭受水灾的民众。十月二十二，朝廷免除朝鲜红参的厘税，促进双方贸易。
十一月十四，滇越边界联接中法的电线建设完成。朝廷首次设置北洋海军提督一职，任命丁汝昌担任。十一月十八，冬至日，皇帝在圜丘祭祀上天。十一月十九，朝廷免除朝贺仪式。十一月二十，朝廷免除静海积水淀地的地租。
十二月初四，朝廷赈济阿迷、蒙自等地遭受疫灾的民众。十二月初七，朝廷下诏，宣布光绪十五年举行恩科乡试，十六年举行恩科会试。十二月十三，朝廷增设吉林水师营总管等官职。十二月十五，太和门发生火灾，震惊朝野。次日，皇帝下诏反思自省，敕令大臣们勤于职守。十二月十七，朝廷免除陕西前年百姓拖欠的钱粮赋税。十二月十九，太后下旨，因多地发生水灾，停止并减少颐和园的工程建设。御史余联沅、屠仁守、洪良品分别上疏请求停止修建铁路，徐会沣等人也上奏条陈相关意见，朝廷将这些奏疏一并下发至海军署与军机大臣商议。不久，翁同龢、奎润、游百川、文治等人也纷纷表示铁路不应修建，这些奏疏同样被下发讨论。朝廷任命太仆少卿林维垣协助办理台湾开垦与抚番事务。十二月二十四，朝廷赈济威远厅遭受水灾的民众。十二月二十五，道员徐承祖此前出使日本，因存在虚报冒领等问题，被革职接受调查，其家产也被查抄。十二月三十，郑州决口成功合拢。朝廷授予吴大澂河东河道总督一职，恢复李鸿藻、倪文蔚原官职，并给予优等奖励，同时释放成孚、李鹤年，允许他们返回。
清光绪十五年（1889年）正月初一，朝廷依例停止举办筵宴。正月十四，靖远、皋兰发生地震，给当地带来震动。正月十五，张之万被任命为东阁大学士，徐桐以吏部尚书身份协办大学士。海军衙门会同军机处商议驳回停止修建铁路的各类奏疏，并请求详细讨论。太后下旨，让庆裕、定安、曾国荃、张之洞、黄彭年等人结合当下形势，各自陈述见解。正月十九，惇亲王去世，光绪皇帝侍奉皇太后前往吊唁祭奠。正月二十一，御史屠仁守上奏称，太后即将归政，但时事复杂，密折奏事仍应书写“皇太后圣鉴”，经太后批阅后再施行。太后下旨斥责此建议荒谬，将屠仁守罢去御史之职，并交相关部门审议，原奏折也被退回。正月二十二，御史林绍年请求禁止督抚向朝廷进献财物，太后下旨斥责了他的提议。正月二十七，皇帝大婚典礼圆满完成。
二月初二，吴大澂奏请朝廷商议尊崇醇亲王的典礼，太后下旨斥责，并通告朝廷内外臣民。二月初三，皇太后正式归政。光绪皇帝亲临太和殿接受朝贺，并向天下颁布诏书。二月初十，朝廷免除江淮地区光绪初年受灾和丰收地区的各项税粮。二月十三，因齐东等州县发生水灾，朝廷从山东库银中拨出五万两用于赈灾。二月十六，朝廷为皇太后加徽号，并颁布诏书广泛施恩。二月十八，朝鲜为庆贺光绪皇帝亲政，进献特产，皇帝赏赐朝鲜国王及王妃绸缎布匹。
三月初一，朝廷任命侍讲崔国因为出使美国、日本、秘鲁大臣。三月初二，彭玉麟请求辞去巡阅长江水师的职务，朝廷温言劝慰挽留。濮州发生黄河决口。三月初八，因布鲁克巴部长归顺，朝廷赐予其封号、印信和敕书。三月初九，朝廷从黑龙江库银中拨出二万两，增加对呼兰地区灾民的赈济。三月十二，皇后祭祀先蚕。三月十四，再次为皇太后加徽号。三月二十五，朝廷免除云南遭受匪患村寨的钱粮赋税。同日，光绪皇帝侍奉皇太后前往颐和园，观看水陆军事演练。朝廷准许阎敬铭回乡养病。
四月初二，朝廷调拨十万石南漕粮，用于赈济山东灾民。四月初三，朝廷赈济奉天、吉林受灾民众。四月十五，朝廷赏赐湖南按察使薛福成三品京堂，任命他为出使英国、法国、意大利、比利时大臣。太后下旨，从内库拨出十万两白银，用于赈济山东灾民。四月二十四，朝廷赐张建勋等三百三十一人不同等级的进士及第或出身。
五月初七，朝廷停止秋季的死刑处决。五月十四，朝廷赈济泸州火灾中的受灾民众。
六月初一，岑毓英去世。六月初二，王文韶被任命为云贵总督。六月初四，朝廷开始重修太和门。六月十二，朝廷赈济周家口火灾中的受灾民众。六月十七，永定河道出现职位空缺，李鸿章举荐合适人选。光绪皇帝怀疑此举有权力下移之嫌，对李鸿章进行了斥责。
七月初三，章丘发生黄河决口。七月初五，朝廷免除贵州西良山的定额赋税。七月二十六，齐河发生黄河决口。七月二十七，沁河决口。当月，朝廷赈济莒州、沂水的雹灾，周家口的水灾，长安、西乡、鄜州的水灾和雹灾，以及云南昆阳、太和，安徽霍丘等州县的水灾。
八月初一，朝廷命令李鸿章、张之洞会同海军衙门筹办芦汉铁路。八月十三，朝廷截留十万石新漕粮，以备山东赈灾之用。八月十八，因四川发生水灾，朝廷捐款五万两赈济灾民。八月二十三，天坛祈年殿发生火灾。八月二十六，朝廷赈济伊犁、绥定等地的地震灾民。八月二十七，朝廷免除贵州遭受贼患的府厅州县卫未征收及百姓拖欠的税粮。
九月初八，朝廷开始重修祈年殿。朝廷赈济温州等地的风灾和水灾。九月初九，朝廷免除陕西各地区前年拖欠的赋税。朝廷赈济咸宁等地的水灾和雹灾。九月十一，朝廷赈济皋兰等地的水灾。九月十八，长垣堤坝决口，黄河水涌入滑县。九月二十二，朝廷谕令定安等人革除东三省练兵中的不良习气。九月二十三，朝廷决定明年的祈谷仪式暂时在圜丘举行。
十月初一，朝廷赈济阳曲等地的雹灾和水灾。十月初四，朝廷架设西安至嘉峪关的电线。朝廷赈济杭州、嘉兴、湖州地区的水灾。十月十三，因江浙地区遭受雨水灾害，朝廷分别从国库拨出五万两白银，并从内库拨出五万两白银进行赈济。因张之洞订购机器时仓促签订契约，朝廷下诏严厉斥责，并规定今后凡是创设新事物，未先奏明，不得轻易行事。十月十五，朝廷从武昌国库拨出十万两白银，作为湖北的赈灾储备。十月十八，朝廷下诏，各省布政使和按察使仍可单独上奏议事。台湾地区的社番发生叛乱，副将刘朝带等人在战斗中牺牲，朝廷敕令刘铭传前往剿灭。十月二十，朝廷再次从浙江国库拨出十五万两白银，赈济杭州、嘉兴、湖州的受灾民众。十月二十五，山东大寨的河工工程合龙。十月二十八，朝廷拨出苏皖地区赈济捐款的余款，用于修建运河。朝廷赈济绥德等地区的雹灾和水灾。
十一月初十，朝廷批准海军衙门的请求，户部每年拨出二百万两白银用于开办铁路。十一月十一，朝廷下诏裁减多余官员，削减不必要的费用。十一月十二，朝廷从安徽漕折银中拨出三万两，作为安庆、宁国、泗州的赈灾储备。十一月二十，浙江发放常平仓的粮食，赈济天台、仙居等地的难民。
十二月初一，朝廷免除杭州、嘉兴、湖州应缴纳的漕白粮以及地丁税。十二月初三，朝廷截留四万石山东漕米，用于赈灾。十二月初六，朝廷再次从武昌国库拨出五万两白银，作为湖北的赈灾储备。十二月十六，山东西纸坊的决口合拢。十二月二十二，朝廷重申禁止在办理免除和缓征赋税过程中的积弊。朝廷免除云南受匪患侵扰村寨的钱粮赋税。十二月二十六，朝廷免除郑州、淮宁、尉氏等州县的税粮，以及仁和等县和杭州、严州卫所的粮课。
这一年，朝鲜按照惯例前来进贡，延续着与清朝的宗藩关系。
清光绪十六年（1890年）正月初一，朝廷按惯例停止举办筵宴活动。正月二十，朝廷免除直隶在光绪十三年以前拖欠的灶课赋税，减轻了当地灶户的负担。正月二十六，朝廷谕令，本年皇帝万寿节无需举行告祭仪式，停止升殿大礼，同时免去各省文武大员进京祝寿的安排。
二月十一，张曜上奏称，综合核算山东河工所需费用为二百八十八万多两，朝廷命令相关部门筹备资金。二月十八，台湾内山番社的首领有敏等人被诛杀，维护了当地的稳定。本月，朝廷免除榆林等州县光绪十三年拖欠的赋税，免除东川遭受水灾的官田税粮，还免除了文安、静海、霸州淀泊地区拖欠的租税以及伯都讷的地课。
闰二月初一，朝廷赈济桂林各地区遭受火灾的民众。闰二月初八，朝廷任命太仆寺卿张荫桓在总理各国事务衙门任职。闰二月十四，光绪皇帝侍奉皇太后拜谒东陵，为减轻百姓负担，免除了皇帝一行经过地区十分之三的定额赋税。闰二月十九，光绪皇帝亲临端慧皇太子园寝祭奠。闰二月二十二，皇帝结束谒陵行程返回。闰二月二十四，曾纪泽去世，不久朝廷赐予他特殊谥号。朝廷还谕令李鸿章整顿北洋水陆军，定安等人训练东三省的军队。
三月初一，太后下旨，命刘铭传协助办理海军事务。西宁发生地震，朝廷对受灾民众进行赈济抚恤。三月十一，因皇帝二十岁万寿节，朝廷向天下颁布诏书，广泛施恩。三月十五，朝廷疏浚余杭南湖，改善当地水利条件。瞻对番目撒拉雍珠与巴宗喇嘛勾结野番发动叛乱，官军出兵将其平定。
四月十一，彭玉麟去世。四月三十，朝廷谕令整顿土药（鸦片）的税厘征收工作。朝廷命刚毅详细考察徐州土药的出产情况以及征税的实际数额，并严格制定整理章程。四月二十九，朝廷赐吴鲁等三百三十六人不同等级的进士及第或出身。
五月初一，发生日食现象。五月初三，色楞额去世，朝廷任命长庚为伊犁将军。五月初八，朝廷任命升泰为驻藏大臣。五月十一，光绪皇帝前往大高殿祈雨。五月十七，皇帝在画舫斋观看侍卫的步射演练，此后一直到五月二十四都如此。五月二十一，终于降下雨水。朝廷修筑阌乡沿河的石坝，增强防洪能力。朝廷赈济淮宁等县遭受风灾的民众。
六月初一，朝廷迁移齐东各州县濒临黄河的村民二千多户，以保障他们的安全。六月初九，三姓金矿开始开采。六月初十，因藏事平定，朝廷颁发给布鲁克巴部长敕书和印信。从五月二十八到六月初十，朝廷接连举行祈晴仪式。六月十二，京城附近因连绵大雨成灾，京师六门外增设粥厂，朝廷命令从京仓拨出一万五千石米煮成粥赈济灾民，还从内库拨出五万两白银作为赈济资金。六月十三，永定河决口。六月十四，永北属土司章天锡图谋叛逆，官军前往讨伐并将其斩杀。六月十八，朝廷拨出奉天运往京城的粟米，并截留江北漕米，以备天津地区的灾荒赈济。六月二十五，皇帝万寿节，在乾清宫接受朝贺。
七月初六，镇康的土族发生叛乱，官军将其剿灭平定。朝廷下诏斥责李鸿章，要求他尽快堵塞合龙永定河决口。七月初十，朝廷拨出五万两白银、五十万贯大钱和十万石米，赈济顺天各地区的受灾民众。七月十三，朝廷谕令严厉惩处那些在发放赈款过程中侵吞克扣的行为。七月二十一，朝廷分别从部库和海关拨出共计三十万两白银，用于资助永定河的河工修复。七月二十四，朝廷任命翰林院侍读许景澄为出使俄、德、和（荷兰）、奥大臣，道员李经方为出使日本大臣。朝廷还赈济湖北、广西、陕西、云南遭受水灾的民众。
八月初二，朝廷再次拨出十万石京仓米，以备顺天地区的赈济之需。八月初五，光绪皇帝前往醇亲王府邸探视病情。八月初九，刘锦棠请求回乡，朝廷仍然给予他假期。八月十二，因刘铭传擅自兴办商矿，所定章程存在错误，朝廷谕令停止相关活动，并将其交予相关部门审议。八月十七，朝廷截留五万石漕米，拨出十万两库银，以备山东地区的赈济。八月二十二，因顺天和直隶遭受水患，朝廷谕令王公各府以及京旗庄田都要减少租税。本月，朝廷免除陕西、江西拖欠的赋税，还赈济陕西遭受水灾和雹灾的地区、云南遭受水灾的地区以及台湾遭受风灾的地区。
九月初六，户部奏报禄米仓亏空十五万石，仓场侍郎兴廉、游百川被交予相关部门审议，不久后二人都被革职。九月初七，朝廷赈济珲春、宁古塔遭受水灾的民众。九月十三，御史吴兆泰请求停止颐和园的工程建设，朝廷给予他严厉的处分。永定河决口成功合拢。九月十五，朝廷赈济甘肃遭受雹灾的民众。九月二十一，石埭发生会匪叛乱，官军将其平定。九月二十二，朝廷从部库拨出资金和仓米，用于顺天地区的备灾赈济。
十月十四，朝廷任命刘坤一为两江总督兼南洋大臣。十月十七，曾国荃去世，朝廷追赠他为太傅。十月十八，朝廷再次拨出五万石京仓米，以备顺天地区的赈济。朝廷免除奉天、直隶、山东、河南商贩的杂粮税捐，促进商业流通。
十一月初六，朝廷赈济湖南遭受水灾州县的民众。十一月十六，光绪皇帝侍奉皇太后亲临醇亲王府邸探视病情。十一月十八，醇亲王去世，朝廷停止上朝七日，光绪皇帝侍奉皇太后亲临醇亲王府邸探视入殓情况，皇太后还赐予祭奠。朝廷命令醇亲王之子镇国公载沣即日承袭王爵。皇帝穿上丧服，太后下旨确定醇亲王的称号为“皇帝本生考”，十一月二十，太后下旨赐予醇亲王谥号为“贤”，皇帝要为其守孝一年。
十二月十四，太后下旨晋封辅国公载洵为入八分镇国公，镇国将军载涛为不入八分辅国公。十二月十七，醇贤亲王的金棺被奉移至园寓，光绪皇帝亲自送到適园。十二月二十四，朝廷延缓南苑工程的建设。十二月二十六，朝廷免除浙江各厅州县场在光绪初年拖欠的赋税。
清光绪十七年（1891年）正月三十日，四川雷波地区的夷族匪帮接受朝廷招抚，边疆局势暂时得到缓和。
二月初十，朝廷截留十六万石海运漕米，以备顺天、直隶地区春季赈济安抚百姓之用。二月初六，御史高燮曾上奏请求恢复日讲制度，朝廷认为该制度往往有名无实，未予采纳。二月十八，朝廷命令李鸿章、张曜共同检阅北洋海军，加强军事视察。刘锦棠因守丧离开职位，朝廷任命陶模为新疆巡抚。同月，云南发生匪乱，富民、禄劝县城一度被攻陷，好在官军及时行动，成功平定叛乱。这个月，朝廷还免除了湖北、山西光绪十三年以前拖欠的赋税，减轻了两地百姓的经济负担。
三月初七，朝廷下令资助遣返各地难民，助其归乡。三月初九，皇后举行祭祀先蚕的仪式，以倡导重视农桑。三月十二，朝廷开始修筑宝坻、通州、蓟州等州县的河工，改善水利设施。三月十七，朝廷命令李鸿章负责督修关东铁路，推动交通建设。三月二十，刘铭传因患病被免去职务。
四月初七，朝廷为醇贤亲王建立庙宇，以表尊崇；四月十六，又修建相关祠宇。四月三十，颐和园工程完工，光绪皇帝开始侍奉皇太后前往游览，这座皇家园林自此成为皇室活动的重要场所。
五月初七到初十，连续降雨。五月十一，皇后亲自参与采桑活动。五月二十二，朝廷赈济清江等地遭受风灾的民众。当月，京畿地区出现蝗灾，形势严峻。总理各国事务衙门鉴于各省教案频繁发生，奏请朝廷下令查办。朝廷下谕指出，各国传教本载于条约，各地应保护好商民和教士的人身财产安全。然而，焚毁教堂事件却同时发生，显然是有匪徒散布谣言滋事，要求各督抚严厉缉拿惩治，确保社会安定。
六月初八，朝廷下谕要求严厉缉拿会匪，维护社会秩序。六月十八，朝廷下诏，规定会匪自首，或有人密报匪首信息并协助抓获的，均可免罪。六月二十一，王文韶上奏，称已诛杀参与叛乱的参将鲍虎。巧家厅披沙的蛮族首领禄汶芢被处死，云南的二十一个夷族山寨也接受招抚。
七月二十二，根据王文韶的奏报，云南猛参、猛角、猛董土司的划界纷争得以平息。朝廷授予孟定土知府罕忠邦宣抚使衔，让土目罕荣高管理猛角、猛董，并准许土千总一职世袭，通过这种方式稳定地方秩序。七月二十四，张曜去世。
八月初一，朝廷赐予乐亭德高望重的儒者史梦兰四品卿衔，以示褒奖。八月初二，朝廷任命奕劻总理海军事务，定安、刘坤一协助办理。八月初八，世祖康熙皇帝御制的《劝善要言》翻译成汉文完成，朝廷将其颁布至各直省学官，要求每月初一、十五与《圣谕广训》一同宣讲，以教化民众。宝鋆在这个月去世。八月二十八，朝廷谕令各地疆吏整饬营伍，革除积习，严禁军队与不良势力勾结包庇。
九月二十八，朝廷免除陕西前年拖欠的赋税。九月初一，自同治十二年以来，外国公使觐见清朝皇帝都在紫光阁。本月，德国公使巴兰德认为这种安排将他们视为藩属，多次要求更换觐见地点。等到奥匈帝国公使毕格哩本前来，便在承光殿进行了觐见，这一外交礼仪的变化，折射出当时复杂的国际关系。九月初三，云南北胜土州同实行改土归流政策，加强中央对地方的管理。
十月初二，朝廷免除隰州、榆次等地拖欠的赋税及旗租。十月十八，朝廷下诏，班禅额尔德尼转世灵童将于明年正月举行坐床大典，派升泰、苏呼诺门罕前往主持，并颁发敕书和珍贵礼物。十月十九，朝廷批准将宋儒游酢列入文庙从祀，彰显对传统儒学的推崇。十月二十三，热河朝阳发生匪乱，提督叶志超、聂士成奉命前往，成功将其平定。
十一月初二，因热河匪首被擒杀，朝廷下谕，无论民间百姓是否加入匪帮，都允许改过自新，主动脱离匪帮前来归顺的，一律予以赦免。十一月初十，朝廷任命户部侍郎崇礼、兵部侍郎洪钧在总理各国事务衙门任职。十一月十四，海运仓发生火灾。十一月十九，因喀喇沁旗发生匪乱，朝廷拨出三万两库银进行赈济安抚，同时赈济汉口火灾中的受灾民众。
十二月初三，朝廷免除河南光绪初年拖欠的赋税。十二月十二，朝廷赈济热河遭受匪乱的灾区。十二月十五，朝廷再次谕令内务府节约费用开支。
这年冬天，朝廷免除浙江、陕西本年百姓拖欠的税粮，在经济上给予民众一定喘息空间，缓解民生压力。